jueves, 22 de marzo de 2018

Información sobre la evolución de la nueva variante del virus de la enfermedad hemorrágica del conejo (GI.2) y la identificación de nuevas cepas recombinantes


Información sobre la evolución de la nueva variante del virus de la enfermedad hemorrágica del conejo (GI.2) y la identificación de nuevas cepas recombinantes

Primera publicación: 11 de febrero de 2018
 
https://doi.org/10.1111/tbed.12830
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    HERRAMIENTAS
     

    Resumen

    La enfermedad hemorrágica del conejo (RHD) es una enfermedad viral que afecta al conejo europeo. La RHD se detectó en 1984 en China y se diseminó rápidamente por todo el mundo, lo que provocó una disminución importante de las poblaciones de conejos silvestres. El agente etiológico, virus de la enfermedad hemorrágica del conejo (RHDV), es un virus ARN de la familia Caliciviridae , género Lagovirus.. Se han caracterizado cepas patógenas (G1-G6 o variantes GI.1a-GI.1d) y no patógenas (GI.4). En 2010, se detectó una nueva variante de RHDV, RHDV2 / RHDVb / GI.2 en Francia. GI.2 llegó a la Península Ibérica en 2011, y se informaron varios eventos de recombinación. Aquí, secuenciamos genomas completos de 19 muestras recolectadas en Portugal entre 2014 y 2016. Se detectaron nuevas cepas recombinantes GI.2, incluidas las recombinantes triples. Estos recombinantes poseen una proteína p16 no estructural relacionada con una cepa no patógena. Se realizaron análisis evolutivos en secuencias GI.2 VP60. El tiempo estimado para el ancestro común más reciente (tMRCA) sugiere un surgimiento de GI.2 en julio de 2008, no distante de su primera detección en 2010. Este es el primer estudio sobre GI.


    Pequeños mamíferos como centinelas de estafilococos resistentes a los antimicrobianos

    Pequeños mamíferos como centinelas de estafilococos resistentes a los antimicrobianos

    1. 1. 
    2. 2. 
    Comunicación corta
    Primero en línea: 09 de marzo de 2018

    Abstracto

    Un total de 39 estafilococos coagulasa negativos y siete cepas de Staphylococcus aureus se aislaron de heces de mamíferos pequeños, es decir, el ratón de campo rayado ( Apodemus agrarius ) y el ratón de cuello amarillo ( A. flavicollis ) en dos áreas de muestreo: bosque caducifolio y karst llanuras. El análisis MALDI-TOF reveló cinco especies de estafilococos coagulasa negativos: S. sciuri , S. hominis , S. warneri , S. haemolyticus y S. xylosus . Todas las cepas fueron susceptibles a tetraciclina, linezolid, vancomicina y teicoplanina. Se detectaron tres cepas de MRSA con el gen mec A. El gen de beta-lactamasa blaZse detectó en estafilococos resistentes a la ampicilina y en las cepas resistentes de alto nivel (oxacilina sobre 2 mg / l) del gen mecA . El gen mecC no fue detectado por PCR. Los estafilococos resistentes a la eritromicina albergaban el gen ermC y / o el gen de eflujo msrA . No hubo genes dfr detectables en los estafilococos resistentes a la trimetoprima y las cepas resistentes a la rifampicina no presentaron mutación en el gen rpoB . En resumen, los pequeños mamíferos salvajes pueden servir como centinelas de S. aureus positivo para mecA con genes de resistencia a eritromicina ermC y eflux msrA. Los pequeños mamíferos parecen ser indicadores útiles de la resistencia a los antibióticos.

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    Referencias

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    Las características de la infraestructura superan las variables ambientales que explican la abundancia de conejos alrededor de las autopistas


    Las características de la infraestructura superan las variables ambientales que explican la abundancia de conejos alrededor de las autopistas


    Autores: Planillo, Aimara ; Malo, Juan E.

    Fuente: Ecology and Evolution , Volumen 8, Número 2, 1 de enero de 2018, pp. 942-952 (11)

    Editorial: Wiley-Blackwell

    DOI: https://doi.org/10.1002/ece3.3709

    Este artículo es de acceso abierto bajo los términos de la licencia Creative Commons CC BY .

    La perturbación humana se extiende a través de los paisajes en forma de caminos que alteran las poblaciones de vida silvestre. Saber qué características del camino son responsables de la respuesta de la especie y su relevancia en comparación con las variables ambientales proporcionará información útil para medidas de conservación efectivas. Muestreamos la abundancia relativa de conejos europeos, una especie muy extendida, en los márgenes de las autopistas a escala regional, en un área con gran variabilidad en las condiciones ambientales y de infraestructura. Las variables ambientales incluyeron la estructura de la vegetación, la productividad de la planta, la distancia a las fuentes de agua y la altitud. Las características de la infraestructura fueron el tipo de vegetación en los bordes, el ancho del borde, el volumen del tráfico y la presencia de terraplenes. Realizamos un análisis de partición de la varianza para determinar la importancia relativa de dos conjuntos de variables en la abundancia del conejo. Además, identificamos las variables más importantes y sus efectos modelo promedio después de la selección del modelo por AICc en modelos basados ​​en hipótesis. Como grupo, las características de la infraestructura explicaron cuatro veces más la variabilidad en la abundancia de conejos que las variables ambientales, siendo los efectos del anterior crítico en tramos de autopistas ubicados en paisajes alterados sin hábitat disponible para conejos, como los campos agrícolas. La selección del modelo y los pesos de Akaike mostraron que el ancho del borde y el volumen del tráfico son las variables más importantes que explican el índice de abundancia del conejo, con efectos positivos y negativos, respectivamente. A la luz de estos resultados, la respuesta de las especies a la infraestructura se puede modular a través de la modificación de las características de la autopista, siendo algunas de ellas manejables en la fase de diseño. La identificación de tales características conduce a sugerencias de mejora a través de medidas correctivas y planes de conservación a bajo costo. Como indicación general, mantener los márgenes de la autopista de menos de 10 m de ancho evitará altas densidades de conejos y evitará los efectos no deseados que las poblaciones de conejos pueden generar en algunas áreas. En un paisaje atravesado por una autopista, estudiamos la abundancia relativa de conejos cerca de la autopista y los factores que la explicaron mejor, divididos en factores ambientales (vegetación principal, condiciones climatológicas, distancia al agua) y factores relacionados con la infraestructura (tráfico, borde características).

    Palabras clave: Oryctolagus cuniculus ; paisajes alterados ; perturbación antropogénica ; evaluación de impacto ambiental ; mitigación ; ecología vial

    Tipo de documento: Artículo de investigación

    Fecha de publicación: 1 de enero de 2018





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