Presentamos la detección del virus de la enfermedad hemorrágica del conejo 2 (RHDV2) en el archipiélago de Madeira, Portugal. La circulación viral fue confirmada por RT-qPCR y vp60secuenciación. Los datos epidemiológicos revelaron el brote iniciado en octubre de 2016 en Porto Santo, afectando a conejos silvestres y domésticos. Fue detectado tres meses más tarde en la isla de Madeira. Se identificaron cinco haplotipos y se observó una similitud general genética de 99,54 a 99,89% entre las dos poblaciones virales. Se identificaron polimorfismos únicos de nucleótidos únicos en las cepas del Archipiélago de Madeira, dos de los cuales resultaron en sustituciones de aminoácidos en las posiciones 480 y 570 en la proteína VP60. Investigación filogenética por máxima verosimilitud mostró todos los vp60secuencias del grupo del archipiélago de Madeira junto con los bootstraps altos. El análisis también mostró que las cepas del archipiélago de Madeira están estrechamente relacionadas con las cepas detectadas en el sur de Portugal continental en 2016, lo que sugiere una posible introducción desde el continente. Los datos epidemiológicos y la alta similitud genética indican una fuente común para los brotes de RHDV2 en Porto Santo y Madeira. La actividad humana relacionada con la caza estaba muy probablemente en el origen del brote de Madeira.